In der Vorschau von Buchhaltung, die nur Magpie-Administratoren öffnen können, werden Datensätze aus dem übrigen Magpie bei jedem Öffnen von Buchhaltung in die Bücher übernommen. Gestellte Rechnungen, Rechnungszahlungen und Erstattungen, Ausgaben und Auslagenerstattungen, Shop-Bestellungen mit ihren Warenkosten und Erstattungen, Formularzahlungen, Zahlungen von Unterstützern, Stripe-Gebühren und Stripe-Auszahlungen buchen jeweils einen ausgeglichenen Buchungssatz, der auf den Datensatz verweist. Ändert sich ein Datensatz, wird sein Buchungssatz storniert und die neuen Beträge werden gebucht; bei einer stornierten Rechnung oder einer entfernten Zahlung wird der Buchungssatz storniert.
Ein Datensatz in einer anderen Währung wartet unter Betrag fehlt, bis sein Wert in der Währung der Bücher eingegeben ist. In den Buchhaltungseinstellungen kann jede Ausgabenkategorie und jede Zahlungsart ein eigenes Konto bekommen.