Buchhaltung ist als Demnächst markiert, und nur Magpie-Administratoren, die Admins eines Teams sind, können sie öffnen.
Beim Einrichten der Bücher wird ihr Startdatum festgelegt, und sie werden in der Teamwährung geführt, die sich danach nicht mehr ändern lässt. Magpie legt einen Standard-Kontenplan an, der sich umbenennen, umnummerieren und ergänzen lässt. Ein Buchungssatz wird nur gebucht, wenn Soll und Haben gleich sind, und ein gebuchter Satz wird durch Stornieren korrigiert. Die Seite jedes Kontos zeigt seine Buchungen mit laufendem Saldo, Berichte zeigt die Summen- und Saldenliste zu jedem Datum, und Abgeschlossen bis in den Buchhaltungseinstellungen sperrt Buchungen in einem abgeschlossenen Zeitraum. Jede Änderung an den Büchern steht unter Aktivität.
Rechnungen, Zahlungen, Ausgaben und Verkäufe werden noch nicht in die Bücher übernommen.